Решение
задач на биосинтез. Основные принципы:
Биосинтез белка происходит в
цитоплазме на рибосомах шероховатой эндоплазматической сети. 1. транскрипция –
синтез иРНК на участках ДНК происходит в ядре. Ген–участок ДНК,
содержащий информацию о структуре белка (о последовательности аминокислот в
белке, о признаке). 2. Трансляция – биосинтез белка на иРНК. В цитоплазме при
наличии рибосом, тРНК, ионы Мg. Генетический код- сочетание нуклеотидов,
в которой зашифрована наследственная информация.
Свойства гена: триплетность
– аминокислоты закодированы в виде 3 нуклеотидов; вырожденность,
избыточность – каждая аминокислота кодируется более, чем 1 кодоном (от 2 до
6); однозначность, специфичность – каждый кодон кодирует только
1 аминокислоту; универсальность – един для всех живущих на Земле
существ; чрезмерность, неперекрываемость – один и тот же
нуклеотид не может входить одновременно в состав 2 или более триплетов; непрерывность
– между триплетами нет знаков препинания, информация считывается непрерывно; помехоустойчивость
– мутации замен нуклеотидов, не приводящие к смене класса кодируемой
аминокислоты, называют консервативными, мутации замен нуклеотидов, приводящие
к смене класса кодируемой аминокислоты, называют радикальными. Особенности
реакций матричного типа: свойсвенны только живым организмам, обеспечивают специфическую
последовательность мономеров, отражают основное свойство живого –
воспроизведение себе подобных, способствуют высокой скорости реакций.
Для решения задач
такого типа необходимо помнить следующие правила и принципы:
Смысловая и
транскрибируемая цепи ДНК антипараллельны. Смысловая цепь начинается с
5´–конца, а транскрибируемая – с 3´–конца. Кодоны и антикодоны принято писать
с 5´–конца на 3´–конец. В таблице генетического кода кодоны записаны с
5´–конца на 3´–конец. Транскрипция идёт в направлении 3´→ 5´, а трансляция в
направлении 5´→ 3´. Если в условии задачи указывается фрагмент только одной
цепи ДНК, то по умолчанию считаем её транскрибируемой (3´→ 5´). Антикодоны
т-РНК антипараллельны кодонам и-РНК.
Синтез новых цепей
идет всегда в направлении от 5'- к -3'. Кодоны в генетическом коде записаны в
направлении от 5'- к -3'. В молекулярной биологии
принято писать смысловую цепь ДНК сверху, а транскрибируемую цепь под ней.
Транскрипция идет
в направлении 3'- -5'. Находим последовательность иРНК по матричной
(транскрибируемой) цепи ДНК (3'- -5') иРНК от 5'- к -3'.
Синтез белка
начинается с того момента, когда к 5'- концу иРНК присоединяется малая
субъединица рибосомы, в которую заходит метиониновая тРНК (тРНК, которая несет
аминокислоту метионин).
Отдельные
последовательности ДНК или РНК, записываются в направлении от 5'- к -3'; в
ответе нужно указывать последовательность антикодон и кодон. Если приводится
взаимодействие кодон – антикодон, расположение триплетов антипараллельно, кодон
иРНК пишется в направлении 5'- к -3', а антикодон тРНК наоборот 3'- -5'.
По таблице
генетического кода находим последовательность аминокислот. Кодоны ищем в
направлении 5'_3'.
По принципу
комплементарности по кодонами иРНК находим антикодоны тРНК: 3'- -5', 3'- -5',
3'- -5'.
Фраза «ответ
поясните» подразумевает, что, кроме самих цепочек нуклеотидов, в ответе будут
пояснения, каким образом эти цепочки были найдены. Чтобы не запутаться при
поиске аминокислот, лучше записать иРНК именно в направлении 5'_3'. Антикодоны
пишутся отдельно друг от друга, так как находятся в разных молекулах тРНК и не
соединяются в единую цепь.
Мы привыкли к
формуле ДНК_ иРНК_ белок. Но по матрице ДНК образуются все типы РНК, в том
числе и тРНК. при решении «задач с центральной петлей» — это находить не один
кодон, а полную цепочку иРНК. Делать этого нельзя, потому что центральная петля
комплементарна только лишь одному кодону, а не всей иРНК искать в таблице
генетического кода не 5'- -3', а 3'- -5'.
Запятые ставятся
только между антикодонами тРНК. Центральная петля тРНК — это не антикодонЫ, а
один антикодон, в одной молекуле тРНК . Тире ставится только между
аминокислотами. Во всех остальных случаях никаких знаков препинания не
требуется.
С РНК содержащего
вируса в результате обратной транскрипции синтезируется ДНК, далее в результате
транскрипции по принципу комплементарности синтезируется иРНК, далее с иРНК
происходит трансляция и собирается белок.
На
основе вирусной РНК по принципу комплементарности строим транскрибируемую цепь
ДНК и записываем её ниже, оставляя строку для записи структуры смысловой цепи
ДНК, т.к. в молекулярной биологии принято писать смысловую цепь ДНК сверху, а
транскрибируемую цепь под ней. Обозначаем
5´ и 3´ концы у транскрибируемой и смысловой цепей.
На
основе транскрибируемой цепи ДНК по принципу комплементарности строим смысловую
цепь и записываем её сверху, над транскрибируемой. На основе транскрибируемой цепи ДНК по принципу
комплементарности строим цепь и-РНК. Состав
и-РНК получается точно такой же, как состав
вирусной РНК (в этом и есть смысл матричного синтеза).
Белки
видоспецифичны, для каждого организма индивидуальны. Разнообразие белков
обусловливает индивидуальную специфичность организмов. Ген – единица
генетической информации, участок молекулы ДНК, в котором закодирована
последовательность аминокислот в белке. Одна т-РНК переносит одну
аминокислоту к месту синтеза белка. Генетический код триплетен – 1 аминокислота
кодируется 3 нуклеотидами (1 триплетом). Антикодон т-РНК комплементарен кодону
и-РНК. Последовательность нуклеотидов и-РНК комплементарна одной из цепей ДНК.
Информацию о структуре белка несет одна из двух цепей ДНК. ДНК является матрицей
для синтеза всех РНК клетки. Ген триплетен: каждая из 20 аминокислот
зашифрована последовательностью из 3 нуклеотидов. Ген вырожден: каждая из 20 АК
шифруется более, чем 1 кодоном (до 6). Код однозначен: каждый кодон шифрует 1
АК. Код универсален: един для всех живых на Земле. Одна и та же
аминокислота у разных организмов кодируется одним и тем же триплетом благодаря
универсальности генетического кода (свойство генетического кода –
универсальность). Считывание информации с кодирующей цепочки ДНК в направлении
3´ → 5´объясняется однонаправленностью генетического кода
Если произошла замена нуклеотида: Генная
мутация – изменится кодон. Произошла замена 1 АК на другую, изменилась ДНК,
иРНК, последовательность аминокислот в белке, первичная структура белка.
Основные фразы, которые можно использовать при решении
данного типа задач:
ДНК двуцепочечная построена по принципу
комплементарности. ДНК матрица для синтеза РНК построить по принципу
комплементарности. иРНК матрица для сборки белковой молекулы. Антикодон тРНК
комплементарен кодону иРНК.
Оставьте свой комментарий
Авторизуйтесь, чтобы задавать вопросы.